马氏珠母贝水通道蛋白基因AQP4 cDNA克隆和表达分析
潘肖兰(1996—), 女, 广西壮族自治区河池市人, 硕士研究生, 研究方向为马氏珠母贝分子遗传育种。E-mail:panxiaolan17@mails.ucas.edu.cn |
收稿日期: 2019-08-19
要求修回日期: 2019-11-28
网络出版日期: 2020-05-19
基金资助
国家贝类产业技术体系岗位科学家(CARS-49)(CARS-49)
海洋生态文明工程项目(ISEE2018PY03)
广东省科技计划项目(2017B0303014052)
版权
Cloning and expression analysis of aquaporin gene AQP4 cDNA from Pinctada fucata martensii
Received date: 2019-08-19
Request revised date: 2019-11-28
Online published: 2020-05-19
Supported by
The Earmarked Fund for Modern Agro-industry Technology Research System(CARS-49)
Marine Ecological Civilization Project(ISEE2018PY03)
Science and Technology Planning Project of Guangdong Province, China(2017B0303014052)
Copyright
水通道蛋白4(aquaporin4, AQP4)是一类被动运输水的通道蛋白。本研究根据转录组测序获得的马氏珠母贝AQP4片段, 采用RACE技术获得了AQP4的全长cDNA, 命名为PfAQP4, 其5′非翻译区(untranslated region, UTR)为114bp, 3′UTR为839bp, 开放阅读框(open reading frame, ORF)为858bp, 编码285个氨基酸。PfAQP4含有6个α螺旋跨膜区、5个环、1个主要内嵌蛋白(major intrinsic protein, MIP)结构域、2个NPA(Asn-Pro-Ala)基序, 属于AQP1-like型。利用qPCR技术分析PfAQP4在不同组织、不同发育时期以及盐度胁迫条件下的mRNA表达模式。结果显示: (1) PfAQP4在所有被检测组织中均表达, 其中在闭壳肌、足和鳃中表达量较高; (2) PfAQP4在不同的发育时期均有表达, 其表达量整体呈现先升高后降低的趋势, 其中在2—4细胞期表达量最高, 在眼点幼虫期表达量最低; (3) 在高盐度组(36‰)盐度胁迫24、72、120h后, PfAQP4表达量显著上升, 在168h降至对照组水平; 在低盐(16‰)组, PfAQP4表达量在24h显著上调, 在72h恢复至对照组水平, 说明盐度影响鳃组织中PfAQP4的表达量, 也表明PfAQP4在马氏珠母贝渗透压调节中起着非常重要的作用。
潘肖兰 , 刘惠茹 , 许濛 , 许瀚之 , 张华 , 何毛贤 . 马氏珠母贝水通道蛋白基因AQP4 cDNA克隆和表达分析[J]. 热带海洋学报, 2020 , 39(3) : 66 -75 . DOI: 10.11978/2019074
Aquaporin 4 (AQP4) is a major channel that passively transports water. In this study, based on a fragment of AQP4 of Pinctada fucata martensii obtained by transcriptome sequencing, the full cDNA was obtained using RACE technology, named PfAQP4, which includes 114 bp of 5'UTR, 839 bp of 3'UTR, and 858 bp of the Open Reading Frame (ORF) encoding a total of 285 amino acids. The PfAQP4 has six alpha-helix transmembrane regions, five loops, one major intrinsic protein (MIP) domain, and two NPAs (Asn-Pro-Ala) motif, indicating that it belongs to AQP1-like type. Real-time fluorescent quantitative PCR was used to analyze the mRNA expression pattern of PfAQP4 in different tissues, different developmental stages, and different salinity stress conditions. The results showed that: (1) PfAQP4 was expressed in all tested tissues, and its expression level was higher in adductor muscle, foot, and gill; (2) in different developmental stages, PfAQP4 was increased first and then decreased, highly expressed in the 2-4 cell stage and lowly expressed in eye-spot larva stage; (3) the expression of gill PfAQP4 mRNA in hypersaline group (36‰) increased significantly at 24h, 72h, and 120h, and returned to the control level at 168 h; in the hyposaline group (16‰), PfAQP4 was significantly up-regulated at 24 h, and the expression level returned to the control level at 72h. These results showed that the salinity can affect the expression of PfAQP4 in gill, and PfAQP4 had a very important effect on the osmoregulation of P. f. martensii.
Key words: Pinctada fucata martensii; aquaporin 4; salinity stress; osmoregulation
表1 本研究所用的引物序列Tab. 1 Primers used in this study |
引物名称 | 引物序列(5′—3′) | 注释 |
---|---|---|
GSP5 | CGATAGCCCAAAGGCAAAAGATA | 5′RACE外引物 |
NGSP5 | GAAGGTGGCAGAGGTACTCTTGAAGG | 5′RACE内引物 |
GSP3 | GTTCGTCTTTGCTGCTCCTTCC | 3′RACE外引物 |
NGSP3 | GACCTGAAGAAGGACGAAAACG | 3′RACE内引物 |
Faqp | CTGTGATGGCGTCAACTGATG | PfAQP4定量引物 |
Raqp | CGCAATCGTGAGAAGATGACC | |
F18S | CGTTTCAACAAGACGCCAGTAG | 内参基因18S定量引物 |
R18S | ACGAAAAAAAGGTTTGAGAGACG |
图1 PfAQP4 的 cDNA全长序列及推导的氨基酸小写字母表示5′UTR和3′UTR序列, 大写字母表示ORF序列, 阴影部分表示SMART预测的MIP结构域, 方框示NPA序列, 下划线示6个跨膜区, *代表蛋白翻译终止子, 粗体aataaa代表polyA加尾信号 Fig. 1 cDNA sequence and deduced amino acid sequence of PfAQP4. Lower case letters indicate 5'UTR and 3'UTR, upper case letters indicate ORF, shaded areas indicate SMART-predicted MIP domains, boxes indicate NPA sequences, underlined letters indicate six transmembrane regions, and * represents protein translation terminator. aataaa in bold represents polyadenylation tail signal |
图2 PfAQP4疏水性示意图1—6表示6个跨膜区; A—E表示5个环; 窗口大小是指用于轮廓计算的间隔长度, 在计算给定残基i的得分时, 考虑以残基i为中心的选定长度区间内的氨基酸 Fig. 2 Hydrophobic plots of PfAQP4. Numbers 1-6 represents six transmembrane regions, A-E represent five loops, and the windows size refers to the interval length used for contour calculation. When calculating the score of a given residue i, the amino acids in the selected length interval centered on residue i are considered |
表2 PfAQP4与其他已知AQP4同源序列氨基酸一致性比较Tab. 2 Amino acid identity comparison of PfAQP4 with other known AQP4 homologues |
物种名 | 多序列比对用缩写名 | 登录号 | 一致性/% |
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马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii) | P.f | MN310685 | 100 |
斑马鱼(Danio rerio) | D.r | ACV73794.1 | 39.5 |
鱇浪白鱼(Anabarilius grahami) | A.g | ROL42342.1 | 37.9 |
斑点叉尾鮰(Ictalurus punctatus) | I.p | AHH42521.1 | 40.9 |
暗纹东方鲀(Takifugu obscurus) | T.o | BAL44699.1 | 40.3 |
小鼠(Mus musculus) | M.m | AAC53155.1 | 40.4 |
大鼠(Rattus norvegicus) | R.n | 2D57 | 41.1 |
智人(Homo sapiens) | H.s | 3GD8 | 42.2 |
非洲爪蟾(Xenopus tropicalis) | X.t | NP_001304774.1 | 39.9 |
长牡蛎(Crassostrea gigas) | C.g | EKC31493.1 | 53.4 |
虾夷扇贝(Mizuhopecten yessoensis) | M.y | OWF48037.1 | 52.2 |
停乳链球菌(Streptococcus dysgalactiae) | SQB67194.1 | 23.4 | |
犬链球菌(Streptococcus canis) | VEE24698.1 | 23.5 |
图4 PfAQP4与其他物种AQP4的多序列比对α1—α6为6个跨膜区, 方框表示NPA基序, 黑色背景白字表示纵列碱基保守性≥50%, 灰色表示纵列各碱基相似, 白色背景黑字表示碱基不保守 Fig. 4 Multi-sequence alignment of PfAQP4 with other species AQP4. α1-α6 represents six transmembrane regions, the box represents the NPA motif, the white letter with black background indicates the column are conserved (≥50%), the gray shading indicates the columns are similar, and the black letter with white background indicates that the residues are not conserved |
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