《热带海洋学报》实行双盲审稿，进入系统流程的稿件，由初审主编（适当考虑作者推荐）确定稿件送审专家。稿件在未能达到可以接受之前，不得有任何作者信息，评审专家信息对任何作者不可见。待稿件经过复审后，由编辑部视情况，邮件通知作者后，方能补充相关作者信息。

稿件录用至少经过编辑部初审，主编初审， 专家初审， 专家复审，主编终审等审稿流程。

每篇稿件首先由编辑和编委初筛，初筛的评判标准一般是：文章是否能引起读者的广泛兴趣、科研成果是否新颖，是否具有广泛的意义。若稿件未通过初筛，一般将在7天内通知作者。通过初筛的稿件将由至少3位同行专家进行评审，并做出录用与否的决定。评审结束后，无论录用与否，编辑部将及时向作者转达评审意见。