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红树林来源链霉菌中2-羟基苯基噻唑啉衍生物及其生物合成基因簇分析
刘思妮, 白猛, 朱义广, 罗小卫, 高程海, 刘永宏, 徐新亚, 蒋晓东
热带海洋学报    2025, 44 (2): 64-72.   DOI:10.11978/2024073
摘要   (204 HTML7 PDF(pc) (4365KB)(533)  

文章探讨和分析了海南红树林沉积物来源链霉菌Streptomyces ardesiacus GXIMD 03502的次级代谢产物及相应生物合成基因簇。通过比对16S rDNA序列信息对菌株进行初步鉴定。综合运用多种色谱分离技术分离其次级代谢产物, 结合波谱数据分析与文献数据比对确定化合物的结构。从该链霉菌中获得5个2-羟基苯基噻唑啉衍生物, 经鉴定分别为 (+)-(S)-pulicatin G (1)、pulicatin A (2)、aerugine (3)、pulicatin F (4) 和 (+)-(S)-dihydraeruginoic acid (5)。采用Illumina novaseq 6000技术对菌株进行基因组测序, 利用生物信息学技术分析、定位及注释负责合成相应化合物的基因簇, 并推导其生物合成途径。该菌株基因组分析结果表明其包含31个次级代谢生物合成基因簇, 其中基因簇11可能参与2-羟基苯基噻唑啉衍生物的生物合成, 并推导了该衍生物的合成途径。


基因 氨基酸长度 同源蛋白 同一性/相似性/% 推测的基因功能
orf1 440 S. venezuelae ATCC10712 sven0503 (CCA53790) 77/81 AMP-ligase
orf2 421 S. venezuelae ATCC10712 sven0504 (CCA53791) 83/87 Na+/H+ antiporter
orf3 647 S. venezuelae ATCC10712 sven0505 (CCA53792) 85/88 AfsR-family regulator
orf4 455 S. venezuelae ATCC10712 sven0506 (CCA53793) 79/85 Salicylate synthase
orf5 282 S. venezuelae ATCC10712 sven0507 (CCA53794) 85/91 TetR-family regulator
orf6 390 S. venezuelae ATCC10712 sven0508 (CCA53795) 75/81 Reductase
orf7 228 S. venezuelae ATCC10712 sven0509 (CCA53796) 90/94 TetR-family regulator
orf8 532 S. venezuelae ATCC10712 sven0510 (CCA53797) 85/90 Salicyl-AMP-ligase
orf9 265 S. venezuelae ATCC10712 sven0511 (CCA53798) 74/80 Thioesterase
orf10 1517 S. venezuelae ATCC10712 sven0512 (CCA53799) 76/82 NRPS
orf11 569 S. venezuelae ATCC10712 sven0513 (CCA53800) 91/95 ABC transporter permease/ATPase
orf12 613 S. venezuelae ATCC10712 sven0514 (CCA53801) 89/93 ABC transporter permease/ATPase
orf13 534 S. venezuelae ATCC10712 sven0515 (CCA53802) 89/94 Radical SAM methyltransferase
orf14 383 S. venezuelae ATCC10712 sven0516 (CCA53803) 78/80 Reductase
orf15 1829 S. venezuelae ATCC10712 sven0517 (CCA53804) 84/89 NRPS
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表2

菌株GXIMD 03502中pulicatins生物合成基因簇内各基因的功能注释

本文的其它图/表